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      當前位置:首頁技術文章質粒提取濃度低的原因

      質粒提取濃度低的原因

      更新時間:2025-08-18點擊次數:1928
       質粒提取濃度低?6大核心原因+解決方案避坑指南的知識干貨,分享給每位同學~

      一、質粒濃度低直接后果:實驗全線崩潰!

      當質粒濃度<50 ng/μL時:

      1. 轉化失敗率↑ 300%

      2. 測序信號弱(峰圖碎裂)

      3. 酶切/連接效率暴跌

      立即排查以下6大關鍵環節!

      二、質粒濃度低的6大核心原因 + 破解方案

      原因1:菌體量不足(占比~35%

      錯誤操作:
      ? OD???0.6 收菌 菌數太少
      ? 離心轉速<6000g → 菌體丟失

      解決方案:

      收菌標準:OD???=0.8-1.0(對數生長期)

      離心參數:≥ 12,000g × 2min(確保菌體沉淀緊密)

      自檢工具:菌泥體積應達 1.5-2ml/L培養基(LB培養基)

      原因2:裂解不徹*(致命環節!)

      裂解失敗標志:溶液粘稠拉絲(基因組DNA污染)

      高頻錯誤:

      錯誤操作

      正確方案

      裂解時間>5min

      ≤4min(強振蕩混勻60s

      未使用RNase A

      添加終濃度100μg/ml RNase

      裂解液溫度<20℃

      預熱至室溫(25℃

      原因3:結合/洗脫效率低(柱膜法專屬)

      硅膠柱關鍵參數:

       

      問題環節

      優化方案

      結合pH偏離

      加中和液后pH=7.0-7.5(試紙監測)

      膜堵塞

      離心前不過濾裂解液(避免雜質堵膜)

      洗脫液未預熱

      60℃預熱的ddH?OEB緩沖液

      洗脫體積過大

      ≤50μl(分兩次洗脫合并)

      原因4:質粒拷貝數低(質粒自身問題)

      低拷貝質粒示例:

      pBR32215-20 copies/cellVS pUC500-700 copies/cell

      破解策略:

      添加 拷貝數增強劑(如氯霉素用于pBR系列)

      更換 高拷貝載體(如pET-28a, pGEX

      原因5:試劑盒性能缺陷(省錢反誤事)

      劣質試劑盒4大罪狀:

      硅膠膜載量<20μg(大提質粒崩潰)

      溶菌酶活性不足(針對革蘭陽性菌)

      乙醇殘留導致酶失活

      內毒素污染(影響轉染)

      選型黃金標準:

      參數

      要求

      載量

      ≥50μg(中提)

      內毒素

      0.1EU/μg

      洗脫濃度

      ≥150ng/μl(實測值)

      原因6:樣本儲存/操作失誤

      DNA降解:

      ? 反復凍融>3→ 濃度折半!

      ? -20℃儲存>6個月 斷裂成小片段

      拯救方案:

      分裝儲存于-80℃(可保存2年)

      溶解時用TE緩沖液(EDTA抑制DNase

      三、質粒解決方案:全流程優化表

      步驟

      操作標準

      質控點

      培養

      37℃ 220rpm ×16h

      OD???=0.8-1.0

      裂解

      輕柔顛倒混勻×8

      溶液透明無粘稠

      中和

      冰浴5min

      pH試紙檢測7.0±0.5

      過柱

      離心≤10,000g ×1min

      液體穿透

      洗脫

      60℃預熱液靜置2min

      回收率>85%

      濃度自檢:A???/A???=1.8-2.0(純度合格)

      聯系方式

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      (全國服務熱線)

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